-
Els investigadors de la URV Roger Guimerà i Marta-Sales Pardo han desenvolupat un model capaç de predir la composició de la microbiota intestinal sense necessitat de fer servir mostres biològiques.
URV
Un equip investigador del grup de recerca de la URV ha desenvolupat un model capaç de reconstruir la composició de la microbiota d'un individu a partir de mostres parcials. A la vegada, també permet plantejar una classificació de la composició microbiana diferent de la que existia fins ara. Els resultats d'aquesta recerca s’han publicat a la revista PNAS Nexus.
Per desenvolupar el model, els investigadors van analitzar composicions microbianes que incloïen cinc estudis previs publicats en revistes científiques. La microbiota intestinal és el conjunt de microorganismes que viuen a l'intestí, com bacteris, fongs, virus o fins i tot paràsits. Es pot considerar un òrgan funcional del cos humà.
"A partir del conjunt de dades experimentals que contenien aquests estudis vam obtenir unes matrius que ens donaven informació sobre la composició microbiana fraccionada en cada tipus o cada agrupació de microbi", explica Marta Sales-Pardo, catedràtica del Departament d'Enginyeria Química de la URV, que ha participat en la recerca.
Fins ara, la classificació de les composicions microbianes es feia en cinc grups diferents, cinc enterotips. Durant la recerca van observar que no existeixen grups estancs de microbiotes, sinó que segueix un model niat, és a dir, que funciona de forma jeràrquica, amb subconjunts, com si fos una nina russa. El model que el grup de recerca ha desenvolupat indica que existeix una microbiota sana amb una composició més general que conté un ecosistema més variat, i una altra de més especialitzada, amb microbis i bacteris més específics.
"Hem fet un model basat en grups que assumeix l'existència de conjunts de persones i de microbis i determinen l'abundància de microbis que té cada grup", comenta Roger Guimerà, investigador ICREA involucrat en la recerca. Segons explica, es tracta d'un model senzill però molt flexible que ha demostrat que té més fiabilitat i precisió que els que hi havia fins ara. Permet determinar si una persona tindrà un determinat microbi o no, la qual cosa facilita el diagnòstic i l'administració de tractament probiòtic indicada en cada cas. "Si et prens un antibiòtic o algun medicament que afecta la microbiota intestinal, amb aquest model es podrà conèixer quins probiòtics i quins bacteris es poden prendre per recuperar-la", conclou.
Aquesta recerca l'ha liderat el grup SEES Lab de la URV amb la col·laboració d'un grup investigador de la Clínica Mayo dels Estats Units.
Per desenvolupar el model, els investigadors van analitzar composicions microbianes que incloïen cinc estudis previs publicats en revistes científiques. La microbiota intestinal és el conjunt de microorganismes que viuen a l'intestí, com bacteris, fongs, virus o fins i tot paràsits. Es pot considerar un òrgan funcional del cos humà.
"A partir del conjunt de dades experimentals que contenien aquests estudis vam obtenir unes matrius que ens donaven informació sobre la composició microbiana fraccionada en cada tipus o cada agrupació de microbi", explica Marta Sales-Pardo, catedràtica del Departament d'Enginyeria Química de la URV, que ha participat en la recerca.
Fins ara, la classificació de les composicions microbianes es feia en cinc grups diferents, cinc enterotips. Durant la recerca van observar que no existeixen grups estancs de microbiotes, sinó que segueix un model niat, és a dir, que funciona de forma jeràrquica, amb subconjunts, com si fos una nina russa. El model que el grup de recerca ha desenvolupat indica que existeix una microbiota sana amb una composició més general que conté un ecosistema més variat, i una altra de més especialitzada, amb microbis i bacteris més específics.
"Hem fet un model basat en grups que assumeix l'existència de conjunts de persones i de microbis i determinen l'abundància de microbis que té cada grup", comenta Roger Guimerà, investigador ICREA involucrat en la recerca. Segons explica, es tracta d'un model senzill però molt flexible que ha demostrat que té més fiabilitat i precisió que els que hi havia fins ara. Permet determinar si una persona tindrà un determinat microbi o no, la qual cosa facilita el diagnòstic i l'administració de tractament probiòtic indicada en cada cas. "Si et prens un antibiòtic o algun medicament que afecta la microbiota intestinal, amb aquest model es podrà conèixer quins probiòtics i quins bacteris es poden prendre per recuperar-la", conclou.
Aquesta recerca l'ha liderat el grup SEES Lab de la URV amb la col·laboració d'un grup investigador de la Clínica Mayo dels Estats Units.
